Script Engine Managerの実装。まずはRhino(JavaScript), Jython(Python), JRuby(Ruby)をサポート。 BSF関連をプラグインにしてロード。 JRubyでコマンドラインからgem install bio JRuby関連をJAR化 呼び出すときは、$LOAD_PATH あとはネイティブ版と同じ。…

Info-Pubmedは、自然言語処理の技術を用いて、文献データからPPIを抽出するWebアプリ。便利なんだけど、セーブできるデータ形式がバイナリ。何とかタブ区切りテキストとか、一括書きだしとかサポートしてもらえないでしょうかね・・・。たぶんユーザー数が10…

Cytoscapeをビジネスに使ってくださってるベンチャー企業。文献データベースからネットワークを抽出する自然言語処理システムを開発、ネットワークビューアとしてCytoscapeを利用。こういう形でコマーシャルとオープンソースが共存して行けるといい。

自分のプロジェクトと近いものを開発しているラボなので、色々と参考になった。

結構たくさんの方が参加してくださって、大成功。

結構長いこと住んでても幾ど回っていないことを実感。

Wynnなどに宿泊。新しいだけあって奇麗だけど、まだ未完成の部分が多い。

SBMLプロジェクトやSystems Biology Workbenchの開発者などの講演を聞く。

SIGGRAPHに参加するために来ていたNetwork Workbenchのチームリーダー（インディアナ大学の方)と会食。今後の協力などについて話し合い。

グリッドなどの活用とWebサービスなどとシームレスな融合等について勉強会。ワークフローを自動化すると言うのは重要な流れの一つ。そんなプロジェクトの一例。http://kepler-project.org/

同じことをするのにも色んな書き方があるのは分かったけど、大規模な場合は規約をきちんと決めないとえらいことになりそうな気が・・・。まあどんな言語でも同じ？とりあえず後発だけあって色々と洗練されているので、この言語を中心に仕事の方でスクリプト…

ようやく意味が分かった・・・

iPhoneのカタログもらってきた。月々６０ドル少々。 物欲が・・・

Rubyの本を買ってみた。 とりあえず雑用をやるスクリプトを書いて慣れようと思う。 Perlよりはすっきりしてるか・・・？Ruby Cookbook (Cookbooks (O'Reilly))作者: Lucas Carlson,Leonard Richardson出版社/メーカー: O'Reilly Media発売日: 2006/07/29メデ…

さて、これに関連して気になったのはこの記事。 基本契約で450分しか通話時間が入っていないというのは「iPhoneであんまり電話をするな」と言っているように見える。 意図的なポジショントークなのか無知なのかは分からないけど、アメリカでは通話料が、夜か…

昼飯を食べに近くのモールへ同僚と出かけたが、運悪く長い行列。で、「どうせだから待ち時間に近くのアップルストア行こう！」と言うことになり、触ってきました、AppleのiPhone。HP200LXから初代Palm Pilot、シグマリオンにTreoまで、いろんなおもちゃに手…

慶応大学の方々が作っているE-Cell 3Dのビデオ。とても綺麗に作られてます。自分のやってるプロジェクト(http://cytoscape.seesaa.net)でも3Dはぜひ取り入れたいんだけど、「そこに次元を一つ足す理由は？」をきちんと説明し、その投資に見合うユーザビリテ…

Pro Java 6 3D Game Development: Java 3D, JOGL, JInput and JOAL APIs (Expert's Voice in Java)作者: Andrew Davison出版社/メーカー: Apress発売日: 2007/04/25メディア: ハードカバー クリック: 3回この商品を含むブログ (4件) を見るJavaはサーバーサ…